Описание бактерии Symbiobacterium thermophilum

 

Надцарство Procaryota
Царство Bacteria
Тип Firmicutes
Класс Bacilli
Отряд Lactobacillales
Род Symbiobacterium
Вид

Symbiobacterium thermophilum

Штамм IAM 14863

 

Symbiobacterium thermophilum

 

Symbiobacterium thermophilum – теплолюбивая бактерия, теплоустойчивый продуцент триптофаназы, которая может расти только совместно со специальным штаммом Bacillus, роль которого заключается в создании специальных условий, пригодных для роста S. thermophilum путем предоставления или удаления метаболитов. Symbiobacterium thermophilum широко распространена в окружающей среде: обитает в почве, кишечнике животных, морской воде, фекалиях, кормах. Чистые культуры могут быть получены путем выращивания бактерии в биореакторе, отделенном от симбиотического партнера диализной мембраной. Из-за своей симбиотической природы она не может быть культивирована традиционными методами. Эта бактерия принадлежит к Firmicutes, несмотря на высокий G+C состав (68,7%). Symbiobacterium thermophilum способна образовывать эндоспоры. Микроскопические наблюдения свидетельствуют о том, что S.thermophilum является первым высоким G+C организмом, способным на это. Геном данной бактерии был секвенирован, для того чтобы понять сам механизм сибиоза с Bacillus sp., в том числе и его причину.

 

Статистические данные о геноме

Компонент

Число белков

Тип

Длина (п.н.)

Средняя длина генов

Состав GC

Процентное
содержание генов в молекуле

Число генов

Хромосома

3335

кольцевая     

3566135

931.921

68.7%

87%

3335

Итого

3335

 

Аминокислотный состав:

Аминокислота

Число

Частота
[%]

A

124082

12.12

C

8913

0.87

D

49799

4.86

E

67659

6.61

F

31822

3.11

G

92116

9.00

H

20198

1.97

I

44995

4.40

K

25493

2.49

L

112328

10.97

M

23108

2.26

N

21183

2.07

P

59461

5.81

Q

34923

3.41

R

85191

8.32

S

44056

4.30

T

50848

4.97

U

3

0.00

V

86927

8.49

W

14838

1.45

Y

25712

2.51

 

Диаграмма длин белков:

Анализ суммарной длины белков:
Средняя длина белка : 308 +/- 199 аминокислотных остатков
Диапазон длин: 30 – 2244 аминокислотных остатков

 

Частота триплетов хромосомы:

 

 

Скачать отчет о бактерии в формате .doc

©2008 Михальченко Алексей